國家自然科學基金委員會現(xiàn)發(fā)布賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究重大研究計劃2025年度項目指南，請申請人及依托單位按項目指南所述要求和注意事項申請。

國家自然科學基金委員會

2025年8月8日

賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究重大研究計劃

2025年度項目指南

核糖核酸（RNA）是生命起源的最初分子形式，多維度參與并調(diào)控重要生命過程。RNA研究在廣度和深度上不斷革新對生命活動基本規(guī)律的認知，已成為生命健康領(lǐng)域發(fā)展最為迅速的研究前沿。RNA科學突破具有巨大的應(yīng)用前景，特別是RNA藥物新興產(chǎn)業(yè)正成為新質(zhì)生產(chǎn)力的重要組成部分。RNA藥物具有靶向性強、成藥靶點多、治療效益高和開發(fā)周期短等優(yōu)勢，是引領(lǐng)下一代藥物研發(fā)的主角。由于對RNA復(fù)雜動態(tài)特性及其調(diào)控規(guī)律研究不足，RNA藥物創(chuàng)制的底層使能技術(shù)缺乏，制約了RNA藥物創(chuàng)新。本重大研究計劃針對RNA藥物研發(fā)的瓶頸問題，立足RNA基礎(chǔ)研究和技術(shù)創(chuàng)新，賦能RNA藥物創(chuàng)制。本計劃的前瞻性部署實施將為我國RNA生物醫(yī)藥發(fā)展提供新機遇，確立我國在RNA研究領(lǐng)域的國際引領(lǐng)地位。

一、科學目標

面向RNA藥物創(chuàng)制的國家重大需求，開發(fā)精準高效、在體原位的RNA研究新體系，整合賦能RNA藥物的多模態(tài)組學數(shù)據(jù)，構(gòu)建數(shù)據(jù)深度挖掘方法，實現(xiàn)跨尺度全生命周期RNA調(diào)控機制解析與功能闡釋；聚焦重大疾病發(fā)生發(fā)展過程中關(guān)鍵RNA的動態(tài)變化特征，挖掘基于RNA的精準診療新靶點，發(fā)展RNA藥物分子智能設(shè)計方法及精準遞送策略，創(chuàng)新RNA藥物研發(fā)的底層使能技術(shù)，實現(xiàn)以“同一健康”為目標的全景式RNA藥物（如人藥、獸藥、農(nóng)藥等）研發(fā)。

二、核心科學問題

（一）RNA復(fù)雜動態(tài)特性的規(guī)律解析與功能闡釋。

針對RNA種類多樣、修飾豐富、結(jié)構(gòu)動態(tài)、功能復(fù)雜等特點所帶來的研究挑戰(zhàn)，從多學科視角揭示RNA的轉(zhuǎn)錄、加工、代謝、翻譯等全生命周期的新規(guī)律及新機制，為RNA藥物創(chuàng)新提供理論基礎(chǔ)。

（二）基于RNA的疾病精準診療與原創(chuàng)靶點發(fā)現(xiàn)。

針對重大疾病發(fā)生發(fā)展過程中RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜、成藥靶點不明的難題，發(fā)展關(guān)鍵RNA的功能表征和精準篩選策略，闡明RNA調(diào)控異常的致病機理，發(fā)現(xiàn)重要標志物及原創(chuàng)靶點。

（三）突破RNA藥物創(chuàng)新瓶頸的底層使能技術(shù)。

針對RNA復(fù)雜性導(dǎo)致的基礎(chǔ)研究及藥物創(chuàng)制短板，開發(fā)高效解析和精準調(diào)控RNA分子的共性技術(shù)，發(fā)展RNA藥物設(shè)計、靶向遞送、生物利用的創(chuàng)新方案，為RNA藥物研發(fā)提供技術(shù)保障。

三、2025年度資助研究方向

（一）培育項目。

圍繞上述科學問題，以本重大研究計劃總體科學目標為牽引，擬以培育項目的方式資助探索性強、選題新穎的申請項目，優(yōu)先支持以下研究方向：

1.關(guān)鍵RNA功能元件解析及調(diào)控機制。

利用多學科交叉研究手段鑒定功能性的RNA元件；深入研究關(guān)鍵功能元件及相關(guān)互作因子在RNA生成、加工、代謝、翻譯等過程中的調(diào)控機制，并揭示其在重要生理過程中的功能；鑒定驅(qū)動重大疾病發(fā)生發(fā)展的RNA元件及互作因子，闡明其致病機理，為RNA藥物智能設(shè)計提供理論依據(jù)。

2.RNA驅(qū)動的重大疾病診斷和干預(yù)。

比較分析生理及病理條件下RNA動態(tài)變化特征，篩選并驗證基于RNA的高靈敏度疾病標志物；發(fā)現(xiàn)和表征特定RNA分子，助力重大疾病的早期篩查和預(yù)后評估；開發(fā)針對疾病相關(guān)RNA的在體降解、高效編輯等技術(shù)，精準校正致病突變或調(diào)控關(guān)鍵基因表達，服務(wù)于重大疾病的有效干預(yù)。

3.基于RNA的病原演化規(guī)律與感染機制解析。

采用跨系統(tǒng)、多組學的全景研究模式，結(jié)合人工智能技術(shù)開發(fā)，系統(tǒng)解析病原及宿主RNA在環(huán)境、種群、個體、器官等不同尺度的數(shù)據(jù)，高效挖掘和預(yù)警新病原，闡明重要已知病原的演化與跨物種傳播規(guī)律；深入研究RNA在病原感染、宿主互作和免疫應(yīng)答過程中的關(guān)鍵作用，為防治病原感染與傳播提供原創(chuàng)靶點和新型策略。

4.功能RNA分子的理性設(shè)計。

從原子尺度揭示RNA的構(gòu)象、能量、動力學等物理化學特性，闡明RNA折疊、互作、催化等基本原理；從頭設(shè)計并合成功能RNA分子，驗證其物理學、化學和生物學特性，并探索在分子傳感、基因調(diào)控、免疫穩(wěn)態(tài)維持、藥物遞送等領(lǐng)域的應(yīng)用。

5.跨尺度RNA數(shù)據(jù)獲取及功能解碼。

開發(fā)多尺度RNA組學及示蹤技術(shù)，解析RNA的序列、結(jié)構(gòu)及修飾特征，揭示RNA功能元件的調(diào)控規(guī)律；開發(fā)多模態(tài)數(shù)據(jù)挖掘的人工智能方法，從海量RNA組學數(shù)據(jù)中提取深層特征，揭示RNA的調(diào)控功能、作用機制與進化規(guī)律；聚焦RNA藥物開發(fā)場景，智能預(yù)測并驗證具有藥物開發(fā)潛力的靶點，精準設(shè)計RNA編輯工具、藥物及疫苗。

6.RNA精準遞送與藥物創(chuàng)制。

揭示RNA分子堿基序列、化學修飾、骨架改造等與其翻譯效率、穩(wěn)定性、免疫原性等關(guān)鍵參數(shù)的映射規(guī)律；闡明RNA載體的化學組成、內(nèi)部構(gòu)造、表面性質(zhì)等對遞送過程的調(diào)控作用；建立適配多元化疾病治療需求的RNA藥物研制技術(shù)體系，系統(tǒng)評價RNA藥物的有效性、安全性和代謝行為等，發(fā)展創(chuàng)新性RNA藥物。

（二）重點支持項目。

圍繞核心科學問題，以總體科學目標為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對于前期研究基礎(chǔ)積累較好，特別是與本重大研究計劃其它申請項目能夠形成學科交叉、優(yōu)勢互補且對總體科學目標形成重要貢獻的申請項目，將以重點支持項目的方式予以資助，優(yōu)先支持以下研究方向：

1.RNA多維修飾圖譜及調(diào)控規(guī)律。

發(fā)展高精度、定點、定量的全轉(zhuǎn)錄組水平RNA修飾檢測新技術(shù)和新方法，繪制RNA多維修飾圖譜并實現(xiàn)功能注釋；建立單分子RNA修飾檢測和操控技術(shù)，支持多種修飾的同時檢測及定點操控；系統(tǒng)識別和表征新型RNA修飾，鑒定新型RNA修飾書寫、擦除、閱讀及其調(diào)控因子；研究RNA化學修飾對在體RNA功能的影響和機制；發(fā)現(xiàn)調(diào)控關(guān)鍵生理及病理過程的重要RNA修飾位點，為提升RNA藥物性能提供科學支撐。

2.RNA動態(tài)結(jié)構(gòu)與原位互作。

建立高通量、高靈敏度、高精度的RNA結(jié)構(gòu)和互作的原位測定技術(shù)，精準捕捉RNA分子的高分辨動態(tài)結(jié)構(gòu)變化過程；發(fā)展功能性RNA連續(xù)大尺度動態(tài)三維結(jié)構(gòu)的新型解析方法，建立動態(tài)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)存儲、分析、展示的新模式；整合并模擬RNA動態(tài)結(jié)構(gòu)及其原位相互作用，系統(tǒng)解析關(guān)鍵生理及病理過程中RNA結(jié)構(gòu)動態(tài)特征及其功能關(guān)聯(lián)機制，為靶向RNA的藥物設(shè)計提供精準靶點和理論支持。

3.RNA定位示蹤與功能操控。

發(fā)展高靈敏、高分辨、低干擾的RNA分子標記與成像的新原理、新方法與新技術(shù)，實現(xiàn)單分子和活體水平上的RNA原位標記與動態(tài)監(jiān)測；解析RNA胞內(nèi)定位的調(diào)控機制，發(fā)展時間、空間可控的RNA加工、運輸、降解等代謝過程的操控技術(shù)，為藥物RNA的體內(nèi)遞送及胞內(nèi)代謝提供關(guān)鍵理論和技術(shù)支持。

4.RNA高質(zhì)量數(shù)據(jù)集及可視化交互平臺。

建立RNA高質(zhì)量數(shù)據(jù)集管理的標準規(guī)范和共享機制，研發(fā)多模態(tài)、跨尺度RNA大數(shù)據(jù)匯交存儲、審編處理和可視化交互的關(guān)鍵技術(shù)；構(gòu)建我國RNA數(shù)據(jù)資源創(chuàng)新平臺，保障數(shù)據(jù)分級分類管理和安全共享，實現(xiàn)RNA大數(shù)據(jù)的高效利用，為賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究提供基礎(chǔ)設(shè)施平臺保障。

四、2025年度資助計劃

2025年度擬資助培育項目30－40項，直接費用資助強度約為80萬元/項，資助期限為3年，培育項目申請書中研究期限應(yīng)填寫“2026年1月1日－2028年12月31日”；擬資助重點支持項目3－5項，直接費用資助強度約為300萬元/項，資助期限為4年，重點支持項目申請書中研究期限應(yīng)填寫“2026年1月1日－2029年12月31日”。

五、申請要求及注意事項

（一）申請條件。

本重大研究計劃項目申請人應(yīng)當具備以下條件：

1.具有承擔基礎(chǔ)研究課題的經(jīng)歷；

2.具有高級專業(yè)技術(shù)職務(wù)（職稱）。

在站博士后研究人員、正在攻讀研究生學位以及無工作單位或者所在單位不是依托單位的人員不得作為申請人進行申請。

（二）限項申請規(guī)定。

執(zhí)行《2025年度國家自然科學基金項目指南》“申請規(guī)定”中限項申請規(guī)定的相關(guān)要求。

（三）申請程序。

1.申請人應(yīng)根據(jù)本重大研究計劃擬解決的核心科學問題和項目指南公布的擬資助研究方向，自行擬定項目名稱、科學目標、研究內(nèi)容、技術(shù)路線和直接費用等。

2.本重大研究計劃項目實行無紙化申請，申請人應(yīng)當按照科學基金網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)（以下簡稱“信息系統(tǒng)”）中重大研究計劃項目的填報說明與撰寫提綱要求在線填寫和提交電子申請書及附件材料。申請書提交日期為2025年9月15日－2025年9月22日16時。

3.項目申請人在信息系統(tǒng)中選擇“在線申請”—“新增項目申請”—“申請交叉科學部項目”進行項目申報。

申請書中的資助類別選擇“重大研究計劃”，亞類說明選擇“培育項目”或“重點支持項目”，附注說明選擇“賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究”，受理代碼選擇T03，根據(jù)申請的具體研究內(nèi)容選擇不超過5個申請代碼。

培育項目和重點支持項目的合作研究單位不得超過2個。

4.申請人在“立項依據(jù)與研究內(nèi)容”部分，首先明確申請對應(yīng)本項目指南中的資助研究方向，以及對解決本重大研究計劃核心科學問題、實現(xiàn)本重大研究計劃科學目標的貢獻。

如果申請人已經(jīng)承擔與本重大研究計劃相關(guān)的其他科技計劃項目，應(yīng)當在申請書正文的“研究基礎(chǔ)與工作條件”部分論述申請項目與其他相關(guān)項目的區(qū)別與聯(lián)系。

（四）申請注意事項。

申請人和依托單位應(yīng)當認真閱讀并執(zhí)行本項目指南、《2025年度國家自然科學基金項目指南》和《關(guān)于2025年度國家自然科學基金項目申請與結(jié)題等有關(guān)事項的通告》中相關(guān)要求。

1.依托單位應(yīng)當按照要求完成依托單位承諾、組織申請以及審核申請材料等工作，于2025年9月22日16時前通過信息系統(tǒng)逐項確認提交本單位電子申請書及附件材料。

2.為實現(xiàn)重大研究計劃總體科學目標和多學科集成，獲得資助的項目負責人應(yīng)當承諾遵守相關(guān)數(shù)據(jù)和資料管理與共享的規(guī)定，項目執(zhí)行過程中應(yīng)關(guān)注與本重大研究計劃其他項目之間的相互支撐關(guān)系。

3.涉及科技倫理與生物安全的項目申請，須嚴格執(zhí)行國家有關(guān)法律法規(guī)和倫理準則，并上傳相應(yīng)證明材料。

4.為加強項目的學術(shù)交流，促進項目群的形成和多學科交叉與集成，本重大研究計劃將每年舉辦1次資助項目的年度學術(shù)交流會，并將不定期地組織相關(guān)領(lǐng)域的學術(shù)研討會。獲資助項目負責人須參加本重大研究計劃指導(dǎo)專家組和管理工作組所組織的上述學術(shù)交流活動，并認真開展學術(shù)交流。

（五）咨詢方式。

國家自然科學基金委員會交叉科學部交叉科學三處

聯(lián)系電話：010-62327096