國家自然科學(xué)基金委員會(huì)現(xiàn)發(fā)布賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究重大研究計(jì)劃2025年度項(xiàng)目指南，請(qǐng)申請(qǐng)人及依托單位按項(xiàng)目指南所述要求和注意事項(xiàng)申請(qǐng)。

國家自然科學(xué)基金委員會(huì)

2025年8月8日

賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究重大研究計(jì)劃2025年度項(xiàng)目指南

核糖核酸（RNA）是生命起源的最初分子形式，多維度參與并調(diào)控重要生命過程。RNA研究在廣度和深度上不斷革新對(duì)生命活動(dòng)基本規(guī)律的認(rèn)知，已成為生命健康領(lǐng)域發(fā)展最為迅速的研究前沿。RNA科學(xué)突破具有巨大的應(yīng)用前景，特別是RNA藥物新興產(chǎn)業(yè)正成為新質(zhì)生產(chǎn)力的重要組成部分。RNA藥物具有靶向性強(qiáng)、成藥靶點(diǎn)多、治療效益高和開發(fā)周期短等優(yōu)勢(shì)，是引領(lǐng)下一代藥物研發(fā)的主角。由于對(duì)RNA復(fù)雜動(dòng)態(tài)特性及其調(diào)控規(guī)律研究不足，RNA藥物創(chuàng)制的底層使能技術(shù)缺乏，制約了RNA藥物創(chuàng)新。本重大研究計(jì)劃針對(duì)RNA藥物研發(fā)的瓶頸問題，立足RNA基礎(chǔ)研究和技術(shù)創(chuàng)新，賦能RNA藥物創(chuàng)制。本計(jì)劃的前瞻性部署實(shí)施將為我國RNA生物醫(yī)藥發(fā)展提供新機(jī)遇，確立我國在RNA研究領(lǐng)域的國際引領(lǐng)地位。

一、科學(xué)目標(biāo)

面向RNA藥物創(chuàng)制的國家重大需求，開發(fā)精準(zhǔn)高效、在體原位的RNA研究新體系，整合賦能RNA藥物的多模態(tài)組學(xué)數(shù)據(jù)，構(gòu)建數(shù)據(jù)深度挖掘方法，實(shí)現(xiàn)跨尺度全生命周期RNA調(diào)控機(jī)制解析與功能闡釋；聚焦重大疾病發(fā)生發(fā)展過程中關(guān)鍵RNA的動(dòng)態(tài)變化特征，挖掘基于RNA的精準(zhǔn)診療新靶點(diǎn)，發(fā)展RNA藥物分子智能設(shè)計(jì)方法及精準(zhǔn)遞送策略，創(chuàng)新RNA藥物研發(fā)的底層使能技術(shù)，實(shí)現(xiàn)以“同一健康”為目標(biāo)的全景式RNA藥物（如人藥、獸藥、農(nóng)藥等）研發(fā)。

二、核心科學(xué)問題

（一）RNA復(fù)雜動(dòng)態(tài)特性的規(guī)律解析與功能闡釋。

針對(duì)RNA種類多樣、修飾豐富、結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)、功能復(fù)雜等特點(diǎn)所帶來的研究挑戰(zhàn)，從多學(xué)科視角揭示RNA的轉(zhuǎn)錄、加工、代謝、翻譯等全生命周期的新規(guī)律及新機(jī)制，為RNA藥物創(chuàng)新提供理論基礎(chǔ)。

（二）基于RNA的疾病精準(zhǔn)診療與原創(chuàng)靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)。

針對(duì)重大疾病發(fā)生發(fā)展過程中RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)復(fù)雜、成藥靶點(diǎn)不明的難題，發(fā)展關(guān)鍵RNA的功能表征和精準(zhǔn)篩選策略，闡明RNA調(diào)控異常的致病機(jī)理，發(fā)現(xiàn)重要標(biāo)志物及原創(chuàng)靶點(diǎn)。

（三）突破RNA藥物創(chuàng)新瓶頸的底層使能技術(shù)。

針對(duì)RNA復(fù)雜性導(dǎo)致的基礎(chǔ)研究及藥物創(chuàng)制短板，開發(fā)高效解析和精準(zhǔn)調(diào)控RNA分子的共性技術(shù)，發(fā)展RNA藥物設(shè)計(jì)、靶向遞送、生物利用的創(chuàng)新方案，為RNA藥物研發(fā)提供技術(shù)保障。

三、2025年度資助研究方向

（一）培育項(xiàng)目。

圍繞上述科學(xué)問題，以本重大研究計(jì)劃總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，擬以培育項(xiàng)目的方式資助探索性強(qiáng)、選題新穎的申請(qǐng)項(xiàng)目，優(yōu)先支持以下研究方向：

1.關(guān)鍵RNA功能元件解析及調(diào)控機(jī)制。

利用多學(xué)科交叉研究手段鑒定功能性的RNA元件；深入研究關(guān)鍵功能元件及相關(guān)互作因子在RNA生成、加工、代謝、翻譯等過程中的調(diào)控機(jī)制，并揭示其在重要生理過程中的功能；鑒定驅(qū)動(dòng)重大疾病發(fā)生發(fā)展的RNA元件及互作因子，闡明其致病機(jī)理，為RNA藥物智能設(shè)計(jì)提供理論依據(jù)。

2.RNA驅(qū)動(dòng)的重大疾病診斷和干預(yù)。

比較分析生理及病理?xiàng)l件下RNA動(dòng)態(tài)變化特征，篩選并驗(yàn)證基于RNA的高靈敏度疾病標(biāo)志物；發(fā)現(xiàn)和表征特定RNA分子，助力重大疾病的早期篩查和預(yù)后評(píng)估；開發(fā)針對(duì)疾病相關(guān)RNA的在體降解、高效編輯等技術(shù)，精準(zhǔn)校正致病突變或調(diào)控關(guān)鍵基因表達(dá)，服務(wù)于重大疾病的有效干預(yù)。

3.基于RNA的病原演化規(guī)律與感染機(jī)制解析。

采用跨系統(tǒng)、多組學(xué)的全景研究模式，結(jié)合人工智能技術(shù)開發(fā)，系統(tǒng)解析病原及宿主RNA在環(huán)境、種群、個(gè)體、器官等不同尺度的數(shù)據(jù)，高效挖掘和預(yù)警新病原，闡明重要已知病原的演化與跨物種傳播規(guī)律；深入研究RNA在病原感染、宿主互作和免疫應(yīng)答過程中的關(guān)鍵作用，為防治病原感染與傳播提供原創(chuàng)靶點(diǎn)和新型策略。

4.功能RNA分子的理性設(shè)計(jì)。

從原子尺度揭示RNA的構(gòu)象、能量、動(dòng)力學(xué)等物理化學(xué)特性，闡明RNA折疊、互作、催化等基本原理；從頭設(shè)計(jì)并合成功能RNA分子，驗(yàn)證其物理學(xué)、化學(xué)和生物學(xué)特性，并探索在分子傳感、基因調(diào)控、免疫穩(wěn)態(tài)維持、藥物遞送等領(lǐng)域的應(yīng)用。

5.跨尺度RNA數(shù)據(jù)獲取及功能解碼。

開發(fā)多尺度RNA組學(xué)及示蹤技術(shù)，解析RNA的序列、結(jié)構(gòu)及修飾特征，揭示RNA功能元件的調(diào)控規(guī)律；開發(fā)多模態(tài)數(shù)據(jù)挖掘的人工智能方法，從海量RNA組學(xué)數(shù)據(jù)中提取深層特征，揭示RNA的調(diào)控功能、作用機(jī)制與進(jìn)化規(guī)律；聚焦RNA藥物開發(fā)場(chǎng)景，智能預(yù)測(cè)并驗(yàn)證具有藥物開發(fā)潛力的靶點(diǎn)，精準(zhǔn)設(shè)計(jì)RNA編輯工具、藥物及疫苗。

6.RNA精準(zhǔn)遞送與藥物創(chuàng)制。

揭示RNA分子堿基序列、化學(xué)修飾、骨架改造等與其翻譯效率、穩(wěn)定性、免疫原性等關(guān)鍵參數(shù)的映射規(guī)律；闡明RNA載體的化學(xué)組成、內(nèi)部構(gòu)造、表面性質(zhì)等對(duì)遞送過程的調(diào)控作用；建立適配多元化疾病治療需求的RNA藥物研制技術(shù)體系，系統(tǒng)評(píng)價(jià)RNA藥物的有效性、安全性和代謝行為等，發(fā)展創(chuàng)新性RNA藥物。

（二）重點(diǎn)支持項(xiàng)目。

圍繞核心科學(xué)問題，以總體科學(xué)目標(biāo)為牽引，立足研究范式創(chuàng)新，對(duì)于前期研究基礎(chǔ)積累較好，特別是與本重大研究計(jì)劃其它申請(qǐng)項(xiàng)目能夠形成學(xué)科交叉、優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)且對(duì)總體科學(xué)目標(biāo)形成重要貢獻(xiàn)的申請(qǐng)項(xiàng)目，將以重點(diǎn)支持項(xiàng)目的方式予以資助，優(yōu)先支持以下研究方向：

1.RNA多維修飾圖譜及調(diào)控規(guī)律。

發(fā)展高精度、定點(diǎn)、定量的全轉(zhuǎn)錄組水平RNA修飾檢測(cè)新技術(shù)和新方法，繪制RNA多維修飾圖譜并實(shí)現(xiàn)功能注釋；建立單分子RNA修飾檢測(cè)和操控技術(shù)，支持多種修飾的同時(shí)檢測(cè)及定點(diǎn)操控；系統(tǒng)識(shí)別和表征新型RNA修飾，鑒定新型RNA修飾書寫、擦除、閱讀及其調(diào)控因子；研究RNA化學(xué)修飾對(duì)在體RNA功能的影響和機(jī)制；發(fā)現(xiàn)調(diào)控關(guān)鍵生理及病理過程的重要RNA修飾位點(diǎn)，為提升RNA藥物性能提供科學(xué)支撐。

2.RNA動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)與原位互作。

建立高通量、高靈敏度、高精度的RNA結(jié)構(gòu)和互作的原位測(cè)定技術(shù)，精準(zhǔn)捕捉RNA分子的高分辨動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)變化過程；發(fā)展功能性RNA連續(xù)大尺度動(dòng)態(tài)三維結(jié)構(gòu)的新型解析方法，建立動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、分析、展示的新模式；整合并模擬RNA動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)及其原位相互作用，系統(tǒng)解析關(guān)鍵生理及病理過程中RNA結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)特征及其功能關(guān)聯(lián)機(jī)制，為靶向RNA的藥物設(shè)計(jì)提供精準(zhǔn)靶點(diǎn)和理論支持。

3.RNA定位示蹤與功能操控。

發(fā)展高靈敏、高分辨、低干擾的RNA分子標(biāo)記與成像的新原理、新方法與新技術(shù)，實(shí)現(xiàn)單分子和活體水平上的RNA原位標(biāo)記與動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)；解析RNA胞內(nèi)定位的調(diào)控機(jī)制，發(fā)展時(shí)間、空間可控的RNA加工、運(yùn)輸、降解等代謝過程的操控技術(shù)，為藥物RNA的體內(nèi)遞送及胞內(nèi)代謝提供關(guān)鍵理論和技術(shù)支持。

4.RNA高質(zhì)量數(shù)據(jù)集及可視化交互平臺(tái)。

建立RNA高質(zhì)量數(shù)據(jù)集管理的標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范和共享機(jī)制，研發(fā)多模態(tài)、跨尺度RNA大數(shù)據(jù)匯交存儲(chǔ)、審編處理和可視化交互的關(guān)鍵技術(shù)；構(gòu)建我國RNA數(shù)據(jù)資源創(chuàng)新平臺(tái)，保障數(shù)據(jù)分級(jí)分類管理和安全共享，實(shí)現(xiàn)RNA大數(shù)據(jù)的高效利用，為賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究提供基礎(chǔ)設(shè)施平臺(tái)保障。

四、2025年度資助計(jì)劃

2025年度擬資助培育項(xiàng)目30－40項(xiàng)，直接費(fèi)用資助強(qiáng)度約為80萬元/項(xiàng)，資助期限為3年，培育項(xiàng)目申請(qǐng)書中研究期限應(yīng)填寫“2026年1月1日－2028年12月31日”；擬資助重點(diǎn)支持項(xiàng)目3－5項(xiàng)，直接費(fèi)用資助強(qiáng)度約為300萬元/項(xiàng)，資助期限為4年，重點(diǎn)支持項(xiàng)目申請(qǐng)書中研究期限應(yīng)填寫“2026年1月1日－2029年12月31日”。

五、申請(qǐng)要求及注意事項(xiàng)

（一）申請(qǐng)條件。

本重大研究計(jì)劃項(xiàng)目申請(qǐng)人應(yīng)當(dāng)具備以下條件：

1.具有承擔(dān)基礎(chǔ)研究課題的經(jīng)歷；

2.具有高級(jí)專業(yè)技術(shù)職務(wù)（職稱）。

在站博士后研究人員、正在攻讀研究生學(xué)位以及無工作單位或者所在單位不是依托單位的人員不得作為申請(qǐng)人進(jìn)行申請(qǐng)。

（二）限項(xiàng)申請(qǐng)規(guī)定。

執(zhí)行《2025年度國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目指南》“申請(qǐng)規(guī)定”中限項(xiàng)申請(qǐng)規(guī)定的相關(guān)要求。

（三）申請(qǐng)程序。

1.申請(qǐng)人應(yīng)根據(jù)本重大研究計(jì)劃擬解決的核心科學(xué)問題和項(xiàng)目指南公布的擬資助研究方向，自行擬定項(xiàng)目名稱、科學(xué)目標(biāo)、研究內(nèi)容、技術(shù)路線和直接費(fèi)用等。

2.本重大研究計(jì)劃項(xiàng)目實(shí)行無紙化申請(qǐng)，申請(qǐng)人應(yīng)當(dāng)按照科學(xué)基金網(wǎng)絡(luò)信息系統(tǒng)（以下簡稱“信息系統(tǒng)”）中重大研究計(jì)劃項(xiàng)目的填報(bào)說明與撰寫提綱要求在線填寫和提交電子申請(qǐng)書及附件材料。申請(qǐng)書提交日期為2025年9月15日－2025年9月22日16時(shí)。

3.項(xiàng)目申請(qǐng)人在信息系統(tǒng)中選擇“在線申請(qǐng)”—“新增項(xiàng)目申請(qǐng)”—“申請(qǐng)交叉科學(xué)部項(xiàng)目”進(jìn)行項(xiàng)目申報(bào)。

申請(qǐng)書中的資助類別選擇“重大研究計(jì)劃”，亞類說明選擇“培育項(xiàng)目”或“重點(diǎn)支持項(xiàng)目”，附注說明選擇“賦能藥物創(chuàng)新的RNA基礎(chǔ)研究”，受理代碼選擇T03，根據(jù)申請(qǐng)的具體研究內(nèi)容選擇不超過5個(gè)申請(qǐng)代碼。

培育項(xiàng)目和重點(diǎn)支持項(xiàng)目的合作研究單位不得超過2個(gè)。

4.申請(qǐng)人在“立項(xiàng)依據(jù)與研究內(nèi)容”部分，首先明確申請(qǐng)對(duì)應(yīng)本項(xiàng)目指南中的資助研究方向，以及對(duì)解決本重大研究計(jì)劃核心科學(xué)問題、實(shí)現(xiàn)本重大研究計(jì)劃科學(xué)目標(biāo)的貢獻(xiàn)。

如果申請(qǐng)人已經(jīng)承擔(dān)與本重大研究計(jì)劃相關(guān)的其他科技計(jì)劃項(xiàng)目，應(yīng)當(dāng)在申請(qǐng)書正文的“研究基礎(chǔ)與工作條件”部分論述申請(qǐng)項(xiàng)目與其他相關(guān)項(xiàng)目的區(qū)別與聯(lián)系。

（四）申請(qǐng)注意事項(xiàng)。

申請(qǐng)人和依托單位應(yīng)當(dāng)認(rèn)真閱讀并執(zhí)行本項(xiàng)目指南、《2025年度國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目指南》和《關(guān)于2025年度國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目申請(qǐng)與結(jié)題等有關(guān)事項(xiàng)的通告》中相關(guān)要求。

1.依托單位應(yīng)當(dāng)按照要求完成依托單位承諾、組織申請(qǐng)以及審核申請(qǐng)材料等工作，于2025年9月22日16時(shí)前通過信息系統(tǒng)逐項(xiàng)確認(rèn)提交本單位電子申請(qǐng)書及附件材料。

2.為實(shí)現(xiàn)重大研究計(jì)劃總體科學(xué)目標(biāo)和多學(xué)科集成，獲得資助的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人應(yīng)當(dāng)承諾遵守相關(guān)數(shù)據(jù)和資料管理與共享的規(guī)定，項(xiàng)目執(zhí)行過程中應(yīng)關(guān)注與本重大研究計(jì)劃其他項(xiàng)目之間的相互支撐關(guān)系。

3.涉及科技倫理與生物安全的項(xiàng)目申請(qǐng)，須嚴(yán)格執(zhí)行國家有關(guān)法律法規(guī)和倫理準(zhǔn)則，并上傳相應(yīng)證明材料。

4.為加強(qiáng)項(xiàng)目的學(xué)術(shù)交流，促進(jìn)項(xiàng)目群的形成和多學(xué)科交叉與集成，本重大研究計(jì)劃將每年舉辦1次資助項(xiàng)目的年度學(xué)術(shù)交流會(huì)，并將不定期地組織相關(guān)領(lǐng)域的學(xué)術(shù)研討會(huì)。獲資助項(xiàng)目負(fù)責(zé)人須參加本重大研究計(jì)劃指導(dǎo)專家組和管理工作組所組織的上述學(xué)術(shù)交流活動(dòng)，并認(rèn)真開展學(xué)術(shù)交流。

（五）咨詢方式。

國家自然科學(xué)基金委員會(huì)交叉科學(xué)部交叉科學(xué)三處

聯(lián)系電話：010-62327096